Вирусни заболувања и инфекциите со патогени се предизвикани од вируси и патогени и може да се појават како локално воспаление или како системско заболување. Често, по периодот на инкубација, тие се манифестираат како краткотрајно заболување со општи симптоми. Вирусите и патогените можат да останат во телото во латентна форма со години без поголеми последици, или да предизвикаат доживотна хронична инфекција и постојано да се размножуваат, и покрај одбрамбените механизми на пациентот. Важна улога во развојот на вирусната или инфекцијата со патогени игра чувствителноста на клетката на вирусот или на патогенот. Со нивното размножување во внатрешноста на клетката, тие можат да го попречат нејзиниот метаболизам и да предизвикаат нејзина смрт, можат да ги променат својствата на клетката и на тој начин да доведат до промена на клетката од нормална во малигна, или да се размножуваат без да ја наруши функцијата на клетката. Вирусите и патогените можат да предизвикаат оштетување на многу органски системи на периферниот нервен систем, дигестивниот систем, црниот дроб, панкреасот, срцето и протокот на крвта, имунолошкиот систем, кожата, мукозната мембрана, уринарниот систем, половите органи. Многу вируси имаат онкогени својства и се поврзани со формирање на некои тумори (на пр. хуман папиломавирус, вирус Епстајн-Бар, вирус на хепатитис Б и Ц).